Blodprov från skånska patienter förbättrar intensivvården

Malin Ivarsson guidar Attila Frigyesi och Hans Friberg runt på Region Skånes biobank, där proverna i Swecrit förvaras.

Med blodprov från runt 10 000 patienter som fått intensivvård i Skåne och data från flera olika kliniska register, innehåller provsamlingen Swecrit information som håller på att förbättra intensivvården. Nu bjuder de ansvariga intensivvårdsläkarna på Skånes universitetssjukhus in forskare från andra delar av landet för att driva på kunskapsutvecklingen.

Intensivvården på Skånes universitetssjukhus har sedan 2014 lett arbetet med att samla in blodprover från patienter på intensivvårdsavdelningar i Skåne. Provsamlingen Swecrit omfattar idag 150 000 blodprov från 10 000 intensivvårdade patienter och är även kopplat till kliniska register.

– Den är den enda i sitt slag i Norden och har stor potential att bidra till att intensivvården utvecklas framöver, säger Hans Friberg, överläkare inom intensivvården i Malmö och professor vid Lunds universitet, som var med och startade arbetet 2014.

Biomarkörer kan visa vägen till rätt behandling 

De vanligaste skälen till att en patient behöver intensivvård är sepsis, akut svår lungsvikt (ARDS), trauma och hjärtstopp, samt under coronapandemin även covid-19. Olika diagnoser kräver olika behandling men det finns även skillnader mellan patienter med samma diagnos. För att bättre kunna anpassa vården till den enskilda patienten är kunskapen om olika biomarkörer avgörande.

– Med hjälp av Swecrit tittar vi till exempel på nya biomarkörer i samband med sepsis och det finns en förhoppning att bättre kunna identifiera och dela upp den heterogena patientgruppen i olika undergrupper, så kallade kliniska fenotyper, säger Attila Frigyesi, överläkare inom intensivvården i Lund och docent vid Lunds universitet.

Tusentals proteiner i en droppe blod 

Planerna framöver är att göra ännu noggrannare analyser av proteiner (proteomik) i de insamlade blodproven. Med hjälp av så kallad masspektrometri analyseras tusentals protein med en droppe blod vilket ger helt nya möjligheter.

– Genom att titta på tusentals proteiner kan vi börja karakterisera tillstånd som sepsis, ARDS, hjärtstopp, covid-19, i kliniskt relevanta undergrupper. Till exempel är sepsis inte en sjukdom utan ett syndrom, målet är att kategorisera undergrupper som behöver olika typer av behandling. Det här kommer att generera enorma mängder data och där har maskininlärning (AI) en viktig roll. I vår forskargrupp ingår matematiker från Matematikcentrum i Lund som är experter på modern maskininlärning, berättar Attila Frigyesi.

Det finns även planer att göra så kallad helgenomsekvensering av delar av provsamlingen. En sjukdomsprocess ändrar olika genetiska uttryck och det läcker ut fragment av DNA ur cellerna.

– Genom analys kan man identifiera vilka celler de kommer från och se vilka celler som skadats och då kan vi avgöra vad det är för sjukdomsprocesser som en patient drabbats av och sätta in rätt behandling utifrån den enskilda patienten, säger Attila Frigyesi.

Bjuder in till samarbetsprojekt

Attila Frigyesi, Hans Friberg och deras kollegor samarbetar redan med andra forskare i landet men bjuder nu in fler att använda materialet i Swecrit i sin forskning.

– Här finns en unik möjlighet för intresserade forskargrupper att besvara frågeställningar som rör biomarkörer hos intensivvårdspatienter, men också att utveckla bioinformatiken kring dessa analyser. Vi tar gärna emot förslag till samarbetsprojekt från andra forskare och sjukhus, både nationellt och internationellt, säger Hans Friberg.

En längre översikt om Swecrit har publicerats i Läkartidningen:
Provsamlingen Swecrit och AI ger ny kunskap vid intensivvård

Fakta Swecrit

Provsamlingen Swecrit är en del av Region Skånes biobank.
Swecrit innehåller blodprov från över 10 000 provtillfällen från intensivvårdade patienter i de stora undergrupperna sepsis, hjärtstopp och trauma samt covid-19 och en mindre grupp friska frivilliga.

Varje provtillfälle har genererat 8 × 200 mikroliter plasma, 8 × 200 mikroliter serum, och därutöver har 6 ml blod (så kallat helblod) samlats in vid ankomst till intensivvårdsavdelningarna.

I provsamlingen finns närmare 150 000 prover.